Waar worden DNase I-overgevoeligheidssites gevonden en wat geven ze aan over de aard van chromatine? Deze plaatsen zijn te vinden op de exon-intron-juncties en geven de plaats aan van mRNA-splitsing tijdens splitsing. Deze sites worden willekeurig door het hele genoom gevonden en het maakt DNA kwetsbaar voor afbraak.
Wat is een DNase I-overgevoelige site en hoe beïnvloedt het chromatine?
In de genetica zijn DNase I-hypergevoelige plaatsen (DHS's) regio's van chromatine die gevoelig zijn voor splitsing door het DNase I-enzym. In deze specifieke regio's van het genoom heeft chromatine zijn gecondenseerde structuur verloren, waardoor het DNA wordt blootgelegd en toegankelijk wordt gemaakt.
Wat suggereert een overgevoelige site voor DNase?
Actieve cis-regulerende elementen zijn overgevoelig voor splitsing door het endonuclease DNase I. Motieven binnen overgevoelige plaatsen voor DNase I duiden op potentiële trans-werkende factorbezetting en, indien gecombineerd met DNase I splitsingsgegevens, kunnen worden gebruikt om voorlopige regelgevende netwerken te bouwen.
Wat is een DNase-overgevoeligheidstest?
Al meer dan twee decennia is de DNase I-hypergevoeligheidstest (DHA) instrumentaal geweest voor het ontdekken van regulerende domeinen (11). Deze methode brengt afzonderlijke plaatsen in het genoom in kaart waar de conformatie van chromatine het DNA ervan overgevoelig maakt voor splitsing door het endonuclease DNase I (12).
Wat is een nuclease-overgevoelige plaats in chromatine?
Inchromatine, nucleosoomvrije regio's die bekend staan als overgevoelige nuclease-sites worden verondersteld de "open vensters" te vertegenwoordigen die verbeterde toegang van cruciale residente cis-werkende DNA-sequenties tot trans-werkende factoren mogelijk maken (zie Refs..
