In de moleculaire biologie is STRING (Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes/Proteins) een biologische database en webbron van bekende en voorspelde eiwit-eiwit-interacties. … De nieuwste versie 11b bevat informatie over ongeveer 24,5 miljoen eiwitten van meer dan 5000 organismen.
Wat is het doel van de STRING-database?
De STRING-database heeft tot doel deze informatie te verzamelen en te integreren, door bekende en voorspelde eiwitassociatiegegevens voor een groot aantal organismen te consolideren.
Wat is een STRING-score?
In STRING wordt elke eiwit-eiwit interactie geannoteerd met een of meer 'scores'. Belangrijk is dat deze scores niet de sterkte of specificiteit van de interactie aangeven. In plaats daarvan zijn het indicatoren van vertrouwen, d.w.z. hoe waarschijnlijk het is dat STRING een interactie als waar beschouwt, gegeven het beschikbare bewijs.
Waarom interageren eiwitten?
Eiwit-eiwitinteracties (PPI's) zijn fysische contacten van hoge specificiteit die tot stand zijn gebracht tussen twee of meer eiwitmoleculen als gevolg van biochemische gebeurtenissen die worden gestuurd door interacties die elektrostatische krachten, waterstof omvatten binding en het hydrofobe effect.
Wat is functionele associatie?
definitie. Binaire relatie tussen biologische entiteiten wanneer een van hen de ander moduleert in termen van functie, expressie, degradatie of stabiliteit van de ander en de relatietussen de partners is niet direct vast te stellen, dus tussenstappen zijn impliciet aanwezig.
