Omdat DdNTP's een waterstofmolecuul (-H) hebben in plaats van een hydroxylgroep (-OH) gehecht aan de 3'-C van zijn deoxyribose, kan het niet binden aan binnenkomende nucleotiden. Daarom kan toevoeging van DdNTP's tijdens DNA-replicatie worden gebruikt om de synthesereactie te beëindigen.
Waarom stopt de DNA-synthese wanneer een ddNTP wordt ingebouwd in de groeiende DNA-streng?
Als het toegevoegde nucleotide een "dideoxynucleotide" is (Figuur 6.29), zal het 3'-uiteinde van de groeiende streng nu een H hebben in plaats van een OH. Dit voorkomt dat er extra nucleotiden worden toegevoegd; d.w.z. de in vitro DNA-synthese stopt op dit punt.
Hoe beëindigt een ddNTP de DNA-synthese?
Wanneer een ddNTP wordt opgenomen in een keten van nucleotiden, eindigt de synthese. Dit komt omdat het ddNTP-molecuul een 3'-hydroxylgroep mist, die nodig is om een link te vormen met het volgende nucleotide in de keten.
Waarom beëindigen DdNTP's het replicatieproces?
Laboratoriummethoden in Enzymologie: DNA
Dideoxynucleotide trifosfaten worden gemakkelijk opgenomen in een groeiende DNA-keten, maar missen de 3′-hydroxylgroep die nodig is om de keten te laten voortduren, en beëindigt effectief de polymerisatie.
Waarom zorgen Dideoxynucleotiden ervoor dat DNA-replicatie stopt?
Deze ddNTP's ontbreken een 3′-OH-groep die nodig is voor de vorming van een fosfodiesterbinding tussen tweenucleotiden, waardoor de verlenging van de DNA-streng stopt wanneer een ddNTP wordt toegevoegd.
