Daarentegen vallen de meeste eukaryote DNA-ligasen, samen met archaeale en bacteriofaag-enzymen, in de tweede subfamilie; deze enzymen gebruiken ATP als cofactor.
Hebben ligasen ATP nodig?
Twee DNA-ligasen worden vaak gebruikt. … T4-ligase vereist ATP terwijl E. coli-ligase NAD vereist+ (Nicotinamide-adenine-dinucleotide is een co-enzym dat bestaat uit 2 nt verbonden via hun fosfaatgroepen). Beide katalyseren de verbinding van een 5'-fosfaat- en een 3'-OH-groep om een fosfodiesterbinding te vormen.
Waarom hebben ligasen ATP nodig?
De twee stappen van de DNA-ligatiereactie
De DNA-ligatiereactie zelf heeft twee basisstappen. Ten eerste moeten de DNA-uiteinden toevallig botsen en lang genoeg bij elkaar blijven zodat de ligase zich bij hen kan voegen. … Om het enzym in staat te stellen verdere reacties uit te voeren, moet het AMP in de actieve plaats van het enzym worden aangevuld met ATP.
Wat zijn de functie van ligasen?
DNA-ligasen spelen een essentiële rol bij behoud van genomische integriteit door breuken in de fosfodiester-ruggengraat van DNA te verbinden die optreden tijdens replicatie en recombinatie, en als gevolg van DNA-schade en de reparatie. Drie menselijke genen, LIG1, LIG3 en LIG4 coderen voor ATP-afhankelijke DNA-ligasen.
Wat zijn ligasen, werken ze actief of passief?
DNA-ligase is actief tijdens het replicatie, reparatie- en recombinatieproces van DNA. Het wordt veel toegepast bij de reparatie van enkelstrengsbreuken in duplex-DNA van levende organismen met behulp van de complementaire streng van de dubbele helix als sjabloon, terwijl sommige vormen specifiek dubbelstrengs schade kunnen herstellen.
