Aangezien sonicatie mogelijk eiwitten kan afbreken en eiwitepitopen denatureren, hebben we vervolgens de impact van sonicatie op de integriteit van eiwitten beoordeeld.
Kan ultrasoonapparaat eiwitten beschadigen?
Populaire antwoorden (1)
Standaard sonicatieprotocol kan geen eiwitfragmentatie veroorzaken- de energie is te laag. Het mag niet eens denaturatie veroorzaken. Het kan worden gedenatureerd als u het te lang aan ultrasone trillingen tentoonstelt en het monster oververhit. Als u nikkelchromatografie gebruikt, kunnen andere banden gewoon onzuiverheden zijn.
Kan ultrasoonapparaat peptidebindingen verbreken?
Sonicatie kan normaal gesproken de primaire structuur van eeneiwit niet afbreken omdat die structuur (de aminozuursequentie) is opgebouwd uit covalente bindingen die vele malen sterker zijn dan waterstofbindingen en sonicatie kan leveren de energie die nodig is om die bindingen te verbreken.
Breekt ultrasoonapparaat het kernmembraan?
Een korte sonicatie met lage energie kan het plasmamembraan verstoren zonder te veel mitochondriale of nucleaire membranen te breken, waardoor mitochondriën intact blijven.
Is sonicatie nodig voor eiwitextractie?
Oplossing van wasmiddel (bijv. SDS) dat nodig is voor de isolatie van membraaneiwitten, resulteert in een lijmachtig lysaat, voornamelijk vanwege nucleïnezuren. Sonicatie is daarom in dergelijke gevallen vereist om deze nucleïnezuren te verstoren. Sonicatie genereert veel warmte en is niet goed voorveel eiwitten.